然而，其间轴心国在北非的部队，密集在阿拉曼当面不到四十英里宽的一块狭长沙漠地上，他们与克里特岛之间几乎毫无联系。轴心国战线后方利比亚境内的壮丁几乎被抽光，以便把尽可能多的男子送到前线。沿地中海补给线的损失又开始大幅度回升。由于总的紧张形势，对隆美尔装甲集团军的增援只局限于人员和少量的重武器，尽管也运进了大批地雷。三月，意大利部队得到了从本土调遣来的两个新锐步兵师的加强。
快到九月底，隆美尔陆军元帅因健康原因奉希特勒的命令回国休假时，他先是在罗马，后来在柏林似乎都对其部队的防守力量充满信心，虽然他的部队没有得到有力的增援。当然他不考虑轴心国部队任何主动撤退的问题。相反，他和他的副手施图梅将军还信心百倍地宣布，为对付预期的英军进攻，德军将实施攻势防御，而且一旦出现有利时机，德军就毫不犹豫地转入攻势。其实施图梅将军仍然认为“消灭第八集团军并攻打亚历山大港”的想法具有现实的可能性。希特勒本人的判断则比较谨慎，可是他也强调德军在阿拉曼阵地的有利条件。这在北非沙漠中是独一无二的，因为它距离短而且南侧又没有被包围的危险。
与这种乐观情绪相比较，这两位指挥官由于敌人不断增长的空中优势而产生的忧虑——那些到前线访问过的人也都有这种忧虑——就不明显了，尤其是因为戈林常把对德国空军优势的任何一点怀疑都看成是对他个人的一种侮辱。可是在这个时候，凯塞林陆军元帅在罗马却不得不承认，由于他有责任为北非前线提供空中支援，他就没有足够的力量来对马耳他岛施加意大利所要求的那种经常不断的压力。根据卡瓦勒罗九月份的一则日记，凯塞林对他说，德国空军空勤人员烦躁不安，紧张过度，患了“马耳他岛症”。然而，十月十日，在得到尽管不是很大的增援之后，凯塞林跟意大利人一起又开始对马耳他岛实施一系列新的有计划的空袭。可是几天后据所见的结果是得不偿失。所以，在戈林以及后来希特勒本人的干涉下，“压制”马耳他岛的这一新企图就放弃了。现在唯一的抉择是在地中海加强那些提供给轴心国运输船队的空中护航队。
无疑是由于这次制服马耳他岛又告失败，所以十月二十日两个独裁者对此都各抒己见。墨索里尼宣称他与卡瓦勒罗的看法一致，即假若准备工作就绪，最好在六月份就实施登陆作战夺取该岛。而希特勒还是固执己见，他向身边的将领们宣称，要夺取这种设防的岛屿是根本不可能的。