可以想见，犯罪集团是利用东京、名古屋、大阪、博多的新干线的总合车辆所(车库)让乘客消失的，其手法与山手线上的消失事件如出一辙。
同日，札幌都市区的JR北海道函馆本线和千岁本线上的乘客全部消失。
1月6日早晨上班高峰期，从东京出发、经过名古屋、开往京阪神的JR东海道本线上的所有电车的乘客都消失了;首都圈的JR总武线和东京地铁千代田线、半藏门线、东西线、有乐町线，以及东急(注：“东京急行电铁”的简称，日本民营铁路之一，下文的“小田急”也是。)田园都市线上所有电车的乘客也全部消失。
此外，今天——即1月7日——首都圈的JR京浜东北线、小田急小田原线、京王线、东武东上线、东急东横线，阪神的私铁阪急、阪神、近铁各线路，名古屋的私铁名铁、近铁成为袭击目标，上班高峰期的乘客全部消失。
北海道和福冈6日的受害情况尚未确认，但犯罪集团似乎在一天内做了转移，1月7日，仙台和广岛也发生了乘客消失事件。
仙台和广岛遇袭后，日本七大都市区中的铁路乘客都在不断消失。
警察总部占领事件和持续增加的失踪事件让媒体疲于奔命，乘坐电车危险的警告只在互联网发布，所以大量毫无防备的普通民众消失了。
面对这样的危机，即使是应变能力超强的特工也大量消失。
截至1月3日夜，北野和川北等潜伏在日本的某国特工，还有百分之八十五——即一万七千人——平安无事。