顺带的，白皇后还说了说现实世界的情况。随着开膛手宁说出那句我想要活下去，让流在我身体里的罪恶之血，乘着诺亚方舟流传到下个世纪，现实世界中的工藤优作道出了托马斯辛德勒杀害坚村忠彬的动机，那就是他作为计算机行业的巨头，竟然是开膛手杰克的后代。
先前泽田弘树在测试dna探查程序时，就从开膛手杰克用来杀人的短剑上提取到了哈妮查理斯特的基因，和托马斯辛德勒的基因进行交叉对比后，发现了他们其中的血缘关系，而那柄短剑又是辛德勒家的传家宝，如此一来，泽田弘树就发现了托马斯辛德勒的身世。在这样的压力下，他知道一旦他完成诺亚方舟，托马斯辛德勒也会杀了他的，于是在诺亚方舟完成的那天，他自己选择了自杀，但是在那之前将他的意识转入到了诺亚方舟内，并将诺亚方舟释放了出去。
而伴随着现实中托马斯辛德勒承认他的罪行，游戏也宣告了终结。柯南和扮成诸星登志夫的诺亚方舟活了下来，柯南也认出了他就是诺亚方舟，末了还说：虽然你让我们遭遇了各种危险，但其实你是相信我们一定会团结一致，克服所有危机的。所谓的让日本重生，并不是指抹杀第二三代的子孙，而是要让他们不依赖父母的力量克服障碍，通过游戏成长。
诺亚方舟还是掉了金豆豆，他只是想和朋友们一起玩一次而已。好了，你该回到你的世界去了。
工藤新一。
柯南愣了愣，没多问什么，就走出了游戏通道，回到了现实世界。
诺亚方舟被留下了原地，他抹了抹眼泪，下一刻就会一个人环住了肩膀，她还说着特别恶劣的话：啧啧，真是难看啊，诺亚方舟小弟弟。
诺亚方舟涨红了脸：你!
他旋即恼羞成怒道：你不怕我揭穿你的真面目吗，橘真夜。
林宁想了想说：那我就去揭穿江户川柯南的真面目。
诺亚方舟跳起了脚：你卑鄙!
林宁笑得恶劣：那卑鄙的我有个提议，你要不要听一听?
第115章名侦探(40)
林宁从游戏仓内出来，神色莫名。
白皇后：艾米莉亚?
林宁顿了顿才偏过头来看她。
白皇后：发生了什么?
林宁迟疑了下才说道：我向诺亚方舟提了个建议。
这个建议该怎么说呢?诺亚方舟作为在网络上可以无处不在的人工智能，他能做的事情非常多，如果他愿意，他可以继续在网路上监视着日本。再有他其实可以成为单个人的守护灵，就像他可以帮助死神小学生江户川柯南小朋友破解案件，祛除他们可见的黑暗面。而林宁这么提议，是她觉得诺亚方舟有可能不愿意再存在下去，到底他本来就是泽田弘树的化身，作为一个天才，他是寂寞的，而且他也不能做到享受独孤，他的父亲也不在了，这个小孩儿就没有再存在的理由。
林宁只是想给他个动力。
白皇后在听她讲述了个大概后，问：他怎么想的?
林宁如实道：他说他要问你一个问题，再来做决定。
林宁有点猜得着诺亚方舟会问什么，可又有点拿不准，只有等着诺亚方舟问过白皇后，再由白皇后转述给她好了。在这期间，林宁看了下坚村忠彬被杀案，托马斯辛德勒的杀人动机是不想让他是开膛手杰克后代的事让更多人知道，即使开膛手杰克的事情已经过去了一百多年，可他却仍旧过不去心中的那个坎，在意此事被曝光后外界对他的看法，对辛德勒公司因此会产生的负面影响，又或者在杀机产生的那一瞬间，托马斯辛德勒会想那并非他的本意，是他体内杀人恶魔的血在影响他。